A florida puma több súlyos fenyegetéssel néz szembe:
- Élőhely elvesztése: urbanizáció, mezőgazdaság, bányászat töredezi és csökkenti a területüket.
- Gépjármű-ütközések: az utakat átkelő pumák sérülhetnek vagy meghalhatnak.
- Betegségek: macskaleukémia, distemper terjedhet háziállatoktól.
- Inbreeding (rokonodás): kis populáció csökkenti a genetikai diverzitást és a szaporodási sikert.
- Illegális vadászat és kereskedelem: furtogás és az egzotikus háziállat-kereskedelem veszélyezteti a fajot.