A boto delfinek elsősorban halakat és höllőállatokat (crustaceans) esznek. Éltelükben benne van a macskáhal (catfish), sardínák, és más kis csős halak. Lehet, hogy tintahalat (squid), garnélék (shrimp), és más tengeri gerincteleneket is fogyasztanak, és alkalmi vizes madarakat vagy kis állatokat, ha lehetőség adódik.