A farkasok és a kutyák közös őseik vannak, és sok hasonlóságuk is, még ha az egyik vad maradt, a másik domestikált. Vannak azonban néhány fizikai különbség.
Fogak
A fogak az egyik legjellemzőbb különbség. Mindkettőnek ugyanannyi foga van, de a farkas fogai hosszabbak, és erősebb az ólomfogai, amiket a prédá megöléséhez és evéséhez használ. A farkas álla is jelentősen erősebb, kb. 105 kg/cm² (1500 psi) nyomást fejt ki, a német juhászé kb. kétszerese.
Szőrzet
Mindkettőnek kétféle szőre van: hosszú védekezoszőrök és rövidebb, puhább alszőr. A farkasoknál az alszőr vastagszik ősztél/telet a télen át. Évente egyszer, tavaszán lehullatja a szőrzete. A kutyák tavaszán hullatnak, de ősztél is. Néhány fajta, mint a német juhász, egész éven át hullat.
Testfelépítés
A farkasok izmos, szűk mellkasúak, a kutyák tág, hordó alakú mellkassal. A farkasok általánosságban hosszabb lábakkal rendelkeznek, ami hosszabb lépést és távolságot tesz lehetővé a domestikált kutyánál. A farkas fiziólogiája miatt a hátsó mancs gyakran a lábnyomba esik ugyanabban az oldalon, egyenes vonalat képezve. A kutyák általában nem igazítják a hátsó lábakat az elülsőkhöz, a nyomuk csavarogó zigzag vonalat képez.
Farokbázisú mirigy (Pre-caudal gland)
A farkasoknak van farokbázisú mirigyük a farok alján, amivel megjelölik a csorda tagjait. A domestikált kutyák nem igényelnek csorda biztonságát, ezért ez a mirigy hiányzik a kutyafajtáknál.
Szaporodás
A nőstény farkas évente egyszer läufig, február-márciusban, a kutyák 6 havonta, tehát kétszer gyakrabban szülhetnek. Míg a farkasok visszaemésztett étellel etetik a kiskacokat, a kutyák nem teszik ezt.