A sebészhalak számos ragadozó áldozatává válnak:
- Nagyobb halak: Cernyák, snapperek, moréna-ángyalar és bizonyos cápa-fajok
- Tengeri emlősök: Delfinek és bizonyos fókák
- Madarak: Tengeri madarak, mint a fregattamadarak és a bóbik
A kisebb sebészhalak sebezhetőbbek. Az élőhely, a védelmező farokgerincek és a csordaalkatási viselkedés mind befolyásolja a kockázatukat. A ragadóknak az étrendje a rendelkezésre álló áldozatoktól és az évszakoktól függően változik.