A kromosómák száma és szerkezete segíthet meghatározni az evolúciós rokonságokat a fajok között. A kromosómaszám fajjellemző – például az embereknek 23 párja van, a cimpánzoknak 24 pár. A kromosóma szerkezet, beleértve a sávmintákat és gének helyeit, is összehasonlítható a hasonlósági és különbségi régiók azonosítására. Ezek az elemek elemzésével a tudósok betekintést nyernek a fajok evolúciós viszonyába.