A madár koponyájának legpontosabb azonosítása a már ismert madár koponyájával való összehasonlítás révén lehetséges. Sok koponya identitása azonban meghatározó jellegzetességeken alapul. A csőr mérete, alakja és stílusa gyakran a legegyszerűbb azonosító. Más jellemzők: a koponyaház hossza, a koponya magassága és teljes hossza. A lelőhely is segítő tényező.
Általános csőrök
A madár csőrök sok kategóriába esnek: méret, alak, cél. Az általános csőrök sır madár csőrök, amelyek nem rendelkeznek különleges jellegzetességekkel. Szundik, kacsa, emu, luda, papagáj és veréb általános csőrkategóriába esnek. További azonosítás a csőr mérete, alakja és színe alapján lehetséges.
Vékony csőrök
A vékony csőrök hosszúk és keskenyek, az evéshez és más feladatokhoz alkalmazkodva. Közepes-hosszú vékony csőrű koponyák: ostrakatona, kivi, avocet, bekaszin, zerge, lapwing. A fakopács vékony csőrével lyukakat fúr. A kolibri hosszú, vékony csőrével a virágok belsejéből szippantja a nektárt. A vékony csőr hossza, alakja és görbülete szerepet játszik az azonosításban.
Speciális csőrök
A speciális csőröknek egyértelmű jellegzetességei vannak. Csonkakalakú csőrű madarak magévők, rövid és vékony csőrűek rovarévők. A papagáj csonkakalakú, görbé csőre tökéletes ahéjak törésére. A pelikán szájcsőre halak fogására alkalmas. A kacsa és luda lapos csőre a vízből szűri az ételt. A nagy, erős, kagyló alakú csőrök a ragadozó madaraknál hús darabolására szolgálnak, jelzés a ragadozó étrendre.
Koponya méret
A madár koponyájának mérete kizár sok fajta. A madármegfigyelők összehasonlítanak más madarakkal. Pl. kisebb, mint egy veréb, vagy nagyobb, mint egy kacsa koponya sok fajta kizárása. A méret szűkítés után a lelőhely és a csőr jellegzetességei segítenek a pontos azonosításban.
Lelőhely
A lelőhely szerepet játszik az azonosításban. Sok faj csak bizonyos országokban, államokban, régiókban él. A lelőhely szűkítése nagyban segít, mivel a koponya nem utazik messze.