A patkányok sokféle színben előfordulnak, a standard albinó labor patkánytól a barna vagy fekete vad patkányig, vagy az állatkereskedés "hódi" változatáig. Van azonban sok kevésbé gyakori szín, beleértve a szőke, kék és menyét. Ezeket a színeket a gondos tenyésztés eredményezi, és valószínűtlen, hogy véletlenszerűen jelennek meg a populációban. A szokatlanul színezett patkányok úgy viselkednek, mint a gyakori rokonaik, de általában csak speciális tenyésztőktől kaphatók.
Csokoládé
A csokoládé patkányok egyenletes, sötétbarna szőrzetekkel rendelkeznek, nincsenek ticking (színezés változás) jelenségek, ami megkülönbözteti őket a vad barna "agouti" színezéstől. Ezeknek a patkányoknak általában fekete szemeik vannak, de a hulladék gének elhomályosítják a színt kakaóra, és némelyeknél rubin vörös szemeket eredményeznek. A kakaó patkányok is egyenletesen barnák, de világosabb tónusban. A csokoládé és kakaó mindketten a b/b géntől származnak. A Spoiled Ratten Rattery szerint, ha a csokoládé kombinálódik a kékkel, az eredmény egy "klasszikus lila" – hasonlít az amerikai menyétből származó lilára, de rozsdás galamb szürke színnel sötét rubin vagy fekete szemmel.
Szőke (Fawn)
Egyesült Királyságban és Ausztráliában topáznek nevezett ez az agoutiból származó szín egy elhomályosító vörös mutációból (r/r) származik. Ezek a patkányok aranyból narancsig terjedő színekkel, vörös szemmel és kékesszürke hasal és alhóval rendelkeznek. Egy kapcsolódó szín, a barnar, arany szőke patkányt eredményez vörös szemmel és krém hasal. Nem-agouti patkányoknál a szőke mutáció bézs színt produkál. Ez a szín gyakrabban előfordul az állatkereskedésekben, mint a szőke.
Menyét (Mink)
A menyét patkányok nem-agouti patkányok szürkebarna szőrzettel és kissé kék árnyalattal. Fekete szemeik vannak. Egy világosabb variáció ezt a genetikai mutációt lila-nak hívják. Ez a patkány világosabb színezésű, és rozsdás tónusú a szőrzetében. Egy külön mutáció okozza az ausztrál menyétet. Ez a hasonló kinézetű szőrzetszín ezüstbarna, és változhat kékestől meleg szürkéig. Az ausztrál menyét patkányok gyakran ezüstös szőrzetűek fehér pöttyökkel. Amikor a menyét mutáció agouti patkányokban jelentkezik, az eredmény egy fahéj: egy meleg vöröses patkány sötébb őrszárnyakkal és vöröses tickinggel.
Kék (Blue)
A kék patkányok valójában kékesszürke színűek, hasonlítanak az orosz kék macskákhoz. Néhányak sötét picsa kék, mások világos, szinte ezüst színűek. A világosabb kék patkányoknak általában rubin szemeik vannak. Bár hasonlónak tűnnek, a kék patkányok két fő típusa – orosz kék és amerikai kék – valójában eltérő genetikai mutációkból származik. Az orosz kék patkányok fekete patkányok, d/d elhomályosító mutációval, míg az amerikai kék patkányok g/g elhomályosító mutációval rendelkeznek. Az amerikai kék kombinálódhat a menyétellel egy rendkívül világos, rubin szemű patkányt eredményezve, amit platinumnak is neveznek. Az orosz kék az agoutival kombinálódva pöttyös, kékes patkányt eredményez fekete szemmel és ezüst hasal.