Bizonyos szennyező anyagok a tápláléklánc magasabb trófikus szintjeinél károsabbak egy úgynevezett biomagnifikáció (biomagnification) folyamata miatt. A biomagnifikáció akkor történik, ha egy szennyező anyag koncentrációja növekszik, ahogy a táplálékláncban feljebb haladunk.
Ez azért van, mert a szennyező anyagok nem derítenek ki vagy metabolizálódnak könnyen az organismoikon belül, és a szövetekben halmozódnak fel. Amikor a ragadozók elfogyasztják a prédákat, a prédában felhalmozott szennyező anyagokat is beveszik. Ez a ragadozó szövetében magasabb koncentrációhoz vezet, mint a prédában. A folyamat megismétlődik, ahogy a nagyobb ragadozók kisebb ragadozókat fogyasztanak, még magasabb koncentrációkhoz vezetve a tápláléklánc tetején.
A magasabb trófikus szinteken különösen káros szennyezők gyakran tartósak és lipofil (zsírszivárgó). A tartós szennyezők nem bomlanak könnyen a környezetben, a lipofilak a zsírszövetekben halmozódnak fel. Ez a kombináció teszi őket biomagnifikációra hajlamossá, és káros koncentrációkhoz jutásukra a csúcsragadozókban.
Példák: nehézfémek (higany, ólom), rovarirtók (DDT, PCB-ok), ipari kémikáliok (dioxinok, furánok). Ezek a szennyezők felhalmozódhatnak az állatokban és az emberekben, és kapcsolódtak a szaporodási zavarokhoz, fejlődési rendellenességekhez és a rák kockázatának növekedéséhez.
A biomagnifikáció megértése fontos a környezeti szabályozások és menedzsment stratégiák kidolgozásához, hogy minimalizálják hatásukat az ökoszisztémákra és az emberi egészségre.