Az ammoneiták a kréta-paleogén kipusztulási esemény során eltűntek, ugyanaz a katasztrófa, ami befejezte a dinoszauruszok uralmát kb. 66 millió évvel ezelőtt. Amikor egy aszteroida ütközött a Földdel a mai Chicxulub-kráter közelében, az extrém klímaváltozást és széleskörű tüzeket okozta.
Klímaváltozás
Az ütközés hirtelen, dramatikus klímaváltozásokat okozott. Az ammoneiták nem tudtak eléggé gyorsan alkalmazkodni és kihaltak.
Élőhely-elveszés
A széleskörű kárteesés megsemmisítette az ammoneita élőhelyeit. Sok faj sekély vizekben élt, amelyeket az ütközés különösen erősen ért.
Élelmiszer-lánc megzavarás
Az ütközés hatása átterjedt az élelmiszer-hálón, kiküszöbölve sok az ammoneitáktól függő zsákmányfajot.