1. Habitat Loss: A tongai gyík elsősorban „Eua és Tongatapu” őshonos erdei ökoszisztémáiban él. Sajnos ezeket az erdei élőhelyeket nagymértékben kiirtották a mezőgazdaság, a fakitermelés és az emberi települések miatt. A megfelelő élőhelyek elvesztése jelentősen csökkentette a gyík elterjedési területét és populációjának méretét.
2. Invazív fajok általi ragadozás: Invazív fajokat, például elvadult macskákat, patkányokat és mangúzokat telepítettek be Tonga szigeteire, és komoly veszélyt jelentenek a tongai gyíkra. Ezeknek az invazív ragadozóknak magas a szaporodási rátája, és rendkívül hatékonyak a gyíkvadászatban és -fogyasztásban, ami a populáció csökkenéséhez vezet.
3. Klímaváltozás: Tonga, a többi csendes-óceáni szigethez hasonlóan, rendkívül érzékeny az éghajlatváltozásra és a tengerszint emelkedésére. A hőmérséklet és a csapadékmintázat változásai hatással vannak a gyík élőhelyére és táplálékforrásaira. A tengerszint emelkedése az alacsonyan fekvő tengerparti élőhelyeket is eláraszthatja, tovább csökkentve a gyík elérhető elterjedési területét.
4. Korlátozott tartomány: A tongai gyík földrajzilag Tongában két kis szigetre korlátozódik, így ki van téve olyan genetikai problémáknak, mint a beltenyésztés és a genetikai sokféleség hiánya. A szűk eloszlás növeli a helyi fenyegetésekkel szembeni érzékenységet is, mint például az élőhelyek elvesztése vagy egyetlen katasztrófa, amely a lakosság nagy részét kiirthatja.
5. Vadászat és kizsákmányolás: A tongai gyíkra a helyiek élelem és hagyományos orvoslás céljából vadásztak, ami hozzájárul a populáció csökkenéséhez. Egyes esetekben a gyíkot kisállat-kereskedelem miatt is befogták, tovább fogyatkozva ezzel egyedszámát.
Az élőhelyek elvesztése, az invazív fajok, az éghajlatváltozás, a korlátozott elterjedés és a vadászat kombinációja a tongai gyíkpopuláció súlyos csökkenéséhez vezetett. A védelmi erőfeszítések, mint például az élőhelyek helyreállítása, a ragadozók elleni védekezés, a közvélemény tudatosítása és a fogságban való tenyésztési programok, elengedhetetlenek e kritikusan veszélyeztetett faj fennmaradó populációinak megőrzéséhez.