Van azonban néhány kivétel:
* Kis cápák és halak :A fiatal vagy kisebb bálnacápák kiszolgáltatottak lehetnek a nagyobb cápák támadására, különösen akkor, ha még mindig fejlődnek.
* orcas (gyilkos bálnák) :Noha nem gyakori előfordulás, az orkákról ismert, hogy a bálnacápákra ragadoznak. Nagyon intelligensek és képesek nagy zsákmányt vadászni.
* Emberek :Sajnos az emberek komoly veszélyt jelentenek a bálnacápákra olyan halászati gyakorlatok révén, mint a véletlen járulékos fogás és a célzott halászat.
Fontos megjegyezni, hogy a bálnacápákat nem vadásznak rendszeresen más állatok által, hatalmas méretük és védekező mechanizmusuk miatt. Valószínűbb, hogy az emberek fenyegetéseivel, mint más állatokból származnak.