A brazíliai háromujjú lusta populációja több összefüggő tényező miatt csökken:
Élőhelyrombolás
A háromujjú lusta természetes élőhelye a trópusi esőerdők, amelyek elsősorban Dél-Amerikában találhatók. Az erdőirtás ezekben a régiókban rettentő, különösen a szarvasmarhatartás, az infrastruktúra-fejlesztés és a mezőgazdasági tevékenységek kiterjesztése miatt. Ahogy az élőhelyuk zsugorodik, úgy csökken a lusták túlélési és virágzási képessége is.
Vadászat és háziállat-kereskedelem
Bár néhány ország törvénnyel védi a háromujjú lustát, az illegális vadászat még mindig fenyegetést jelent. A vadászok elsősorban húsukért vadászzák őket, mivel némelyek.delikátessznek tartják a lusta húsát. A lusták áldozatai lesznek az illegális háziállat-kereskedelemnek is, ami eltávolítja őket a természetes élőhelyükből, és megfosztja a megfelelő gondoskodástól.
Természetes ragadozók
Természetes ragadozók, mint a nagy macskák (jaguárok), alkalmanként prédálnak a lustákon. Az élőhelyrombolás miatt azonban a lusták idegen területekre vándorolhatnak, és könnyebb célponttá válhatnak a ragadozók számára.
Lassú szaporodási ráta
A lusták általában lassan szaporodnak. A nőstények egyedül egyetlen kölyököt szülnek 1,5–4 évente. Lassú érési periódusuk tovább késlelteti a populáció hatékony feltöltődését. Ahogy az élőhely zsugorodik és az erőforrások csökkennek, a megfelelő pár, étel és fészkelés helye hiánya korlátozhatja a szaporodást.
Az élőhelyrombolás, a vadászat és csapdázás, az illegális háziállat-kereskedelem, a lassú szaporodási ráta és az élőhely-fragmentáció hatása a szaporodásra, túlélésre és az általános fitnessre együttesen borzalmas képet festenek, a brazíliai háromujjú lusta populációját potenciálisan katasztrofális számok felé tereltetik.