A teknősök a hulladékot elsősorban a kloáka által választják ki, egy többcélú nyílás, ami az emésztő, a vizelet- és a szaporodási rendszer közös kimenetele.
- Emésztési hulladék: Az nem emésztett anyag összegyűlik a bélben.
- Széklet kialakulása: A víz és a tápanyagok felvételével a hulladékmerevődik székletté.
- Tárolás a végbélben: A széklet a végbélben tárolódik.
- Kiválasztás: A széklet a kloáka által kerül ki.
- Vizelet kiválasztása: A nitrogénes hulladék, elsősorban mocsav, a vesek szűri ki, és a kloákába kerül.
- Húgyhólyag tárolás: Néhány faj tárolja a vizeletet a húgyhólyagban a kloáka által való kiválasztás előtt.
A kiválasztás gyakorisága a fajta, étrend, környezet és egészségtől függ.