Ma sokféle kígyó létezik. Az emberek ritán gondolkoznak el azon, honnan származnak a kígyók, vagy hogyan fejlődtek ki a mai lényekké. A kréta időszak kulcsfontosságú volt a kígyók evolúciója szempontjából. Ebből az időszakból származó kígyó fosszíliák megerősítették és cáfolták egyaránt az evolúcióval kapcsolatos különféle elméleteket.
Legkorábbi kígyók
A legkorábbi kígyók a kréta időszakban 발달했다고 hihetik. Ezek: Pachydrachis, Pachyophis, Lapparentophis defrenni, Similiophis, Pouitella, Pachyrahachis problematicus, Eupodophis és Haasiophis. A legtöbb kígyó fosszília,约 96-100 millió éves, a Közel-Kelet különböző helyein találták meg.
Tenger elmélet
A 20. század 대부분ében a tudósok azt hitték, hogy a kígyók szárazföldi jászolokból fejlődtek ki, de a század végén sok kígyó fosszíliát találtak tengerszegény üledékben, ezért néhány tudós azt állította, a kígyók tengerenti jászolokból fejlődtek. Ezt az elméletet leginkább az Eupodophis, Pachyrhachis, Haasiophis terrasanctus felfedezése támasztotta alá, amelyeknek két hátsó lába volt, csípővel, térdcsonttal és peronéccsonttal.
Szárazföld elmélet
Amikor 2003-ban Argentinában felfedezték a Najash rionegrina fosszíliát, a tenger elméletet megdöntötték. Ez a kréta korszakból származó kígyónak lábu és csípője volt, ami bizonyítja, nem élhetett a tengeren. A fosszíliának jól definiált szarkuma volt, ami gerinctartót támasztott, és funkcionális hátsó lába volt a bordacsontja kivül. Szárazföldi üledékben találták. Az új elmélet szerint a kígyók szárazon fejlődtek, végül elvesztették a lábukat, ahogy a földbe ásó állatokká váltak.
Modern elmélet
Nehéz fosszília bizonyítékot találni a kígyók evolúciójáról, mert a gerincseik nem fosszílik meg könnyen. Sok tudós ma is váltakozik a tenger és szárazföld elmélet között. A Najash felfedezése után több tengerszegény fosszília üledéket találtak Izrael partjai mentén, és új elmélet született: a kígyók a ma kihalt tengerenti jászolokból, a moszaszaurokból fejlődtek, amelyek az óceanokban elvesztették a lábukat. Ez az elmélet egy legújabb DNS-vizsgálattal cáfolódott, ami azt mutatta, a varanok, ami a moszaszaurok közvetlen utódai, nem rokonaiak a kígyókhoz. A vizsgálat azt mutatta, a kígyók szárazon fejlődtek. Az eltérő meggyőződések ellenére a legtöbb tudós ma nem tagadhatja a Najash kígyó kulcsfontosságú bizonyítékát. A legtöbb paleotológus egyetért abban, hogy a kígyók egy ásó szárazföldi jászolból fejlődtek ki.