A házi légy sok természeti ellenséggel rendelkezik:
Pókok hálóikkal fogják. Madarak mint a fecskék és kékcsirkeik Légközben kapják. Gyíkek mint a geckók és kameleonok falakon kapják. Békák és varangyok ragadós nyelvükkel fogják a légyeket. Imádkozó szitakötők lesnek rájuk. Légycapkók speciális leveleikkel zárják be. Légycapkók ragadós papírt vagy vonzerőket használnak. Peszticidék megölhetik őket, de óvatosan kell használni, hogy ne károsítsák más állatokat és embereket.