A szűrő segít tisztán tartani a haltartályt, ha eltávolítja a szennyeződéseket és a törmeléket a vízből. Néhány hetente azonban továbbra is fontos, hogy tisztítsa meg a haltartályt, hogy a halak számára tiszta és egészséges maradjon. Ez magában foglalja a tartály oldalán nőtt algák eltávolítását, valamint a kavics vagy a szubsztrát tisztítását a tartály alján. A gyártó utasításainak megfelelően rendszeresen módosítania kell a szűrőhordozót is.