Általánosságban elmondható, hogy a halak rövid ideig elviselhetik az ecetsav alacsony koncentrációját. A hosszabb ideig tartó expozíció vagy a magasabb koncentrációnak való kitettség azonban jelentős károkat okozhat. Az ecetsav halakra történő toxicitása a fajtól függően is változik. Egyes halak érzékenyebbek a savasodásra, mint mások.
Az ecetsav befolyásolhatja a víztartály vagy a tó vízminőségét is, különösen, ha nagy mennyiségben adják hozzá. Lecsökkentheti a víz pH -ját, savassá teszi. Ez káros lehet a halakra és más vízi szervezetekre, mivel azok egy adott pH -tartományhoz igazodnak.
Ezért elengedhetetlen, hogy óvatos legyen, ha ecetsavat használnak akváriumokban vagy tavakban. Csak kis mennyiségben és konkrét célokra, például akváriumi berendezések fertőtlenítését vagy bizonyos betegségek kezelését szabad felhasználni. Az ecetsav túlzott használata vagy nem megfelelő használata káros hatást gyakorolhat a halakra és az egyéb vízi életre.