Nincs kifejezés az olyan ökoszisztémákra, ahol fajok veszélyeztetettek. A kontextustól függően használhatók:
Fenyegetett ökoszisztémák: Degradáció vagy pusztítás veszélyeztetett ökoszisztémák.
Kritikus élőhelyek: Területek, amelyek elengedhetetlenek a veszélyeztetett fajok túléléséhez.
Biodiverzitás-forráspontok: Régiók, ahol nagy számú endém faj él fenyegetés alatt.
Veszélyeztetett ökoszisztémák: Kevesebb elfogadott terminológia az ökoszisztéma egészségének fenyegetettségére.
A veszélyeztetett fajok gyakran az nagyobb problémák tünetei, mint élőhely-elveszés, szennyezés, klímaváltozás, bejövelt fajok.