A bálnacápa kihalásának lehetséges következményei között szerepel a tengeri ökoszisztémák zavarai, amelyek a tápanyagok szállítására és a trófikus élelmiszer -háló fenntartására támaszkodnak. Ezek a zavarok viszont befolyásolhatják a többi tengeri fajt, ideértve az emberi fogyasztás céljából betakarított is, de az emberi halászatra gyakorolt hatások valószínűleg közvetettek és nem olyan szörnyűek, mint a túlhalászás, az éghajlatváltozás és az élőhelyek pusztulása.
Végül a bálnacápák minimális közvetlen jelentőséggel bírnak az emberi életben, összehasonlítva más fenyegetett fajokkal, amelyek élelmet nyújtanak, támogatják az ökoszisztéma -szolgáltatásokat, vagy akár tudományos és orvosi betekintés forrásaként szolgálnak.