A folyamatos populációcsökkenés végső következménye a faj kihalása. A kihalás akkor következik be, amikor a populáció egyedszáma olyan kicsivé válik, hogy a faj már nem képes szaporodni vagy túlélni a környezetében.
A genetikai sokféleség elvesztése:
Ahogy egy veszélyeztetett faj populációjának mérete csökken, úgy csökken a genetikai változatossága is. A genetikai sokféleség elengedhetetlen ahhoz, hogy egy faj alkalmazkodni tudjon a környezeti változásokhoz és betegségekhez. A genetikai sokféleség hiánya növelheti a kihalás kockázatát.
Ökológiai egyensúlyhiány:
Egy faj eltűnése jelentős hatással lehet az általa lakott ökoszisztémára. Minden faj sajátos szerepet tölt be a táplálékláncban, és egy faj elvesztése az egész ökoszisztémát megzavarhatja. Ennek lépcsőzetes hatásai lehetnek más fajokra, és akár más fajok kihalásához is vezethetnek, amelyek a veszélyeztetett fajoktól függtek.
A betegség terjedése:
A populáció kis mérete érzékenyebbé teheti a fajokat a fertőző betegségekre. A fertőző betegségek gyorsan terjedhetnek egy kis populáción keresztül, és korlátozott genetikai diverzitás mellett előfordulhat, hogy a fajból hiányzik az e betegségek leküzdéséhez szükséges immunvédelem.
Az élőhelyek elvesztése és töredezettsége:
Az élőhelyek elvesztése és széttagoltsága gyakran együtt jár a népességfogyással. Egy faj populációjának csökkenésével a fajok elterjedési mérete is csökkenhet. Ez a faj élőhelyének elvesztéséhez és feldarabolódásához vezethet, ami tovább súlyosbítja a populáció csökkenését és növeli a kihalás kockázatát.