A fogazott varánuszok több fenyegetéssel szembesülnek:
- Élőhelyvesztés: A mezőgazdaság és az urbán kiterjesztés csökkentette és szétdarabolta az elterjedésüket.
- Illegális vadászat és kiskereskedés: Húsuk, bőrük, hagyományos gyógyszerészet és a házi kedvenc kereskedelem miatt vadászzák őket.
- Klíma változás: Megváltoztatja a hőmérsékletet, csapadékot, ételrendelkezésre állást és szaporodási ciklusokat.
- Predáció és verseny: Vadmacskák és rókák prédálnak rájuk; más ragadozók versenyeznek az ételért.
- Elégtelen jogi védelem: Korlátozott érvényesítés hagyja őket sebezhetővé a kiaknázás előtt.