Ragadozók
Nagy ragadozók, mint a jaguarok és anakondák, a fiatal krokodilokat vadászzák.
Emberek
Vadászat bőrért, húsért és tojásért; néhány faj megtámadja az embereket, ha az ő területükre lépnek.
Betegségek
Baktériális, vírusos és parazita fertőzések halálosak lehetnek vagy hosszú távú egészségügyi problémákat okozhatnak.
Élőhely elvesztése
A fejlettség és a szennyezés elpusztítja a krokodilok élőhelyét.
Klímaváltozás
Az emelkedő tengerszint eláraszthatja a fészkeket, míg a hőmérséklet- és csapadékváltozások befolyásolják az étel és víz elérhetőségét.