Veszélyeztetett fajok
A Sequoia Nemzeti Parkban több állatfaj van szövetségi szinten veszélyeztetettnek minősítve, beleértve a déli Sierra Nevada-i kicsacart (fisher), a Sierra Nevada-i vörös rókát és a kaliforniai kondort.
Veszélyeztetett fajok
A parkban védett fajok is élnek, mint a nagy kanadatevé és a nyugati sárga csüllög.
Sierra Nevada-i vörös róka
Az egyik legkarizmatikusabb veszélyeztetett faj a parkban, a Sierra Nevada-i vörös róka a magas hegyi erdőkhöz alkalmazkodott, és a sűrű növényzetre támaszkodik a fedéshez és aإذا ifjúság neveléséhez. Az erdőirtás, a fejlesztés és a tűzoltás okozta élőhelyelvesztés és -törmelékesedés hozzájárult a csökkenésükhöz. Ma kevesebb mint 500 egyedet becsülnek meg.
Kaliforniai kondor
A kaliforniai kondor, Észak-Amerika legnagyobb repülő szárazföldi madara, legfeljebb 2,7 m szárnyfesztávolságú, a parkban egy másik veszélyeztetett faj. Egyszer a vadonban kipusztultnak verklazták a 1980-as években, de egy sikeres foglyában tartási-tenyésztési programmal újra bevezették. Több mint 500 él most a vadonban.
Védelmi erőfeszítések
A Sequoia Nemzeti Park az Amerikai Hal- és Vadászati Hivatal, a Kaliforniai Hal- és Vadvédelmi Minisztérium és a természetvédelmi szervezetekkel együttműködve figyeli és védi ezeket a fajokat. Az intézkedések közé tartozik az élőhely-helyreállítás, az inváziós fajok ellenőrzése, az ember-vad konfliktus csökkentése és a közoktatás.