Élhely-elvesztés
Az erdőirtás megsemmisíti az esőerdőket, szavannákat és víztározókat, ahol a jaguárok élnek, eltávolítva a vadásztereket, menedéket és szaporodási területeket.
Csökkent ragadozat
Az élhely törlése csökkenti a szarvas, tapir, peccary és más ragadozat populációit, hagyva a jaguárokat elegendő étel nélkül.
Fragmentáció
Az elkülönített erdőjavak akadályozzák a vándorlést, a párosodást és a genetikai diverzitást, beledrozsdáshoz és alacsonyabb szaporodási sikerhez vezetve.
Ember-vad konfliktus
Ahogy az élhely zsugorodik, a jaguárok az emberi települések felé közelednek ételért, növelve a konfliktust és az öléseket a háziállatok védelmében.
Csökkent elterjedés
Kisebb tartományok korlátozzák a jaguárok képességét a ragadozott populációk szabályozására és a magelterjedésre, hatással az egész ökoszisztémára.
Furtolás
Az erdőirtás hozzáférhetőbbé teszi a jaguár élhelyét a vadászkor, akik a szőrért, fogakért és más testrészekért vadásznak.