A kojótok természeti ragadozói
Bár a kojótok sok területen csúcsragadozók, vannak természeti ellenségeik.
Ragadozók
Nagyobb ragadozók, mint a farkasok, a hegyiolvok, a medvék és az alligatorok prédálhatnak kojótokra. A bobcatok és a nagy ragadozó madarak a fiatalabb vagy gyengébb egyedeket célozhatják meg.
A betegségek és a verseny is hatással van a kojót állományaira, bár a prédáció nem gyakori.