- Alacsony genetikai sokféleség: Az alapítóhatás olyan populációhoz vezethet, amelynek alacsonyabb genetikai sokfélesége van, mint a szülői populáció, mivel csak az egyének kis részhalmaza vesz részt egy új populáció alapításában. Ez magasabb szintű beltenyésztési és csökkent genetikai variációt eredményez, ami károsíthatja a népesség azon képességét, hogy alkalmazkodjon a környezetéhez.
- A kihalás fokozott kockázata: Egy kis alapító populáció inkább hajlamos a kihalásra, mint a hatalmas populáció, több tényező miatt, ideértve a megnövekedett beltenyésztést, a csökkentett genetikai variációt és a korlátozott erőforrás -kínálatot. A beltenyésztés a hasonló genetikai anyag párosítása miatt káros tulajdonságok expressziójához vezethet.
- evolúciós divergencia: Az alapító hatás kezdeményezheti az alapított népesség és a szülői népesség evolúciós eltérésének folyamatát. Az idő múlásával az alapított populáció eltérő szelekciós nyomást gyakorolhat és önállóan alkalmazkodhat, ami a genetikai tulajdonságok és a potenciális specifikációs események eltéréseihez vezethet.
- Gyors adaptáció: Bizonyos körülmények között az alapítói hatás gyors adaptációhoz vezethet. Amikor egy kis népesség új és eltérő környezetet tapasztal, akkor erős szelekciós nyomás lehet bizonyos tulajdonságok számára, amelyek segítenek az egyéneknek az új körülmények között fennmaradni. Ez az allélfrekvenciák gyors változásait és az új tulajdonságok fejlődését eredményezheti.
- Genetikai rendellenességek: Az alapítóhatás az egyes genetikai rendellenességek nagyobb előfordulását eredményezheti a populáción belül, mivel az egyének megnövekedett valószínűsége ugyanazon káros alléleket hordoz. Ha káros allélek vannak jelen az alapító populációban, akkor valószínűbb, hogy széles körben elterjednek és befolyásolják a népesség jelentős részét.