Környezeti hatás
A marikultura károsíthatja a környezetet halhulladékkal és meegetlen élelmiszer-szennyezéssel, élőhely pusztítással, betegségterjedéssel, a vad halakkal való versenyért az ételért és erőforrásokért, valamint nehézfémek és más toxinek felhalmozódásával.
Betegségjárványok
A tenyésztett hal üzemek sebezhetők a betegségeknek. Gyakori problémák: baktériális, vírusos, parazita és gombás fertőzések, amelyek komoly gazdasági veszteséget okozhatnak.
Szökés
A szökött tenyésztett halak bekereszthetnek a vad populációkkal, csökkentve a genetikai diverzitást. Versenybe is léphetnek a vad halakkal az ételért és az élőhelyért.
Magas termelési költségek
A marikultura üzem felállítása és üzemeltetése drága. Költségek: halelet, felszerelés, munkaerő, engedélyek, biztosítás.
Piaci verseny
A tenyésztett halaknak verseniezniük kell a vadon fogott tengerészeti termékekkel. Ez a verseny csökkentheti az árakat, megnehezítve a marikultura vállalkozások profitabilitását.
Élelmiszer-biztonsági aggodalmak
Néhány tenyésztett hal magas szintű szennyeződéseket tartalmazhat, mint nehézfémek vagy rovarirtószerek, ami egészségügyi kockázatot jelent a fogyasztók számára.