Mississippi gazdag vadvilághoz ad otthont, több az államra őshonos faj is:
- Mississippi gödörbéka – endemikus Mississippi-ban, szövetségi védett
- Fenyőerdő kígyó – Mississippi és más déleke államok fenyőerdőiben
- Keleti gyémánt csengő kígyó – a világ legnagyobb csengő kígyóinak egyike
- Mississippi kánya – közepes méretű sas, szürke teste, feje fehér
- Vörösfészkű dögfa – kis fekete-fehér dögfa, piros folttal a fején
- Bachman vöröske – nyílt mezőkben és fenyőerdőkben
- Keleti kékharkály – kis kékharkály, rozsdásvörös mellkas
- Amerikai alligator – mocsarakban, folyókban, tavakban
- Mexikói öszvény – nagy, előidősebb kinézetű hal, a Mexikói-öbölben és vízgyűjtőiben
Laposerdő szalamandra – Mississippi és Alabama fenyőerdőiben
Ezek csak néhány példa a Mississippi-ban őshonos sok állatra.