Két gyakori csoport
Az előfordulás fajta és hely szerint változik, de két nagyon gyakori és hatásos endoparazita:
1. Kerekféreg (Nematodák): Széles körben elterjedtek sok állatnál. Példák: aszkaridok, szívféreg, horgosféreg.
2. Protozoák: Egyszeletes szervezők, amelyek különféle betegségeket okoznak. Példák: coccidiák, giardia, Toxoplasma gondii.
Nem kimerítő
Sok más gyakori endoparazita is létezik, például szalagféreg és egérféreg, attól függően, milyen állatfajta van szó.