Egy másik elmélet az, hogy a mastodonok az éghajlatváltozás miatt elhaltak. Észak -Amerika éghajlata többször megváltozott a pleisztocén korszak alatt, és a mastodonok nem tudtak alkalmazkodni a változó körülményekhez. Az éghajlat melegebbé és szárazabbá vált, és az erdők, amelyekben a mastodonok éltek, eltűntek. Ez valószínűleg megnehezítette a mastodonok számára az étel és a menedék megtalálását.
Az is lehetséges, hogy a tényezők, például az emberek vadászata és az éghajlatváltozás kombinációja a mastodonok kihalásához vezetett. A mastodonok nagy, lassan mozgó állatok voltak, és valószínűleg könnyű áldozatot jelentettek az emberek számára. A változó éghajlat még nehezebbé tette a mastodonok túlélését. Bármi legyen is az oka, a mastodonok körülbelül 10 000 évvel ezelőtt kihaltak.