A Kapi-hegizebra sebezhetőnek (Vulnerable) minősül az IUCN szerint. Fő okok:
1. Élőhely-elvesztés
Az elsődleges fenyegetés. Korlátozott területen élnek (Dél-Afrika Nyugati-Kap tartománya). Mezőgazdasági terjeszkedés, urbanizáció és emberi behatás töredezetté és csökkenté az élőhelyüket, nehezítve az étel, víz és menedék megtalálását.
2. Vadászat és furtolás
Korábban húsa és bőre miatt vadásztak rájuk, jelentősen csökkentve a populációt. Ma tilos a vadászat, de a furtolás még mindig előfordul.
3. Verseny a háziállatokkal
Ahová a háziállatokkal közös élőhelyet osztanak meg, ott a legelésért versenykeznak. A háziállatok kiszoríthatják a zebrákat, csökkentve az ételrendelkezésre állást.
4. Genetikai diverzitás vesztése
Kis, töredezett populációk miatt magas a genetikai változatosság elvesztésének kockázata. Ez csökkenti az alkalmazkodóképességet, növeli a beavltes kockázatát és az egészségügyi problémákat.
5. Klímaváltozás
Hőmérséklet-, csapadék- és vegetációváltozások megváltoztathatják az ételforrásokat és az élőhely alkalmasságát. A zebráknak gyorsan kell alkalmazkodniuk, különben tovább csökkennek.
A védelmi erőfeszítések – védett területek létrehozása, élőhely-gazdálkodás, furtolás-ellenőrzés, közösségi részvétel – elengedhetetlenek a Kapi-hegizebra hosszú távú túléléséhez.