St. Bernards -nak általában barna szeme van , néha kissé mogyoró árnyalattal. Noha a kék szem bizonyos ritka esetekben előfordulhat, nem tekintik őket a fajta standard tulajdonságának.
Ha kék szemmel találkozik egy Szent Bernard -tal, akkor valószínűleg genetikai rendellenesség vagy ritka mutáció miatt.