Egy jól működő állatmenhely elkülöníti az újonnan érkező állatokat a általános populációtól, amíg fel nem értékeli az állapotukat. A zsúfolt menhelyek, nélküli hely az elkülönítéshez, gyakran bármely szabad helyre helyezik az újonnan érkezőket. A zsúfoltság növeli a stresszt és csökkenti az immunrendszert az általános populációnál. Még ha az általános populáció egészséges is, a vizsgálat nélküli állatok bevezetése elterjeszti a betegségeket.
Distemper
Mind a kutya, mind a macska distemper, nagyon fertőző vírusos fertőzések, az idegrendszer és a légúti rendszert érintik. Korai symptomák hasonlítanak a megfázásra, szem- és orrfolyadékkal, ami terjeszti a vírust, utána hányás és hasmenés követ. Bár a kölykök ritkán túlélik, a felnőtt állatok gyakran igen, intenzív gondozással. Rutin immunizációk védelmet nyújtanak a distemper ellen.
Kutya Parvovírus (Parvo)
A parvovírus súlyos hányást és hasmenést okoz, gyakran halályos fiatal kölyköknél. Az idősebb kutyák túlélhetik. Ha egyszer bekerül egy kennybe vagy menhelybe, nehéz megszüntetni. A parvovírus túlél sok fertőtlenítőt, bár a 희석etlen klór megtöli. A rutin immunizációs kombinációk általában védelmet nyújtanak a parvo ellen.
Kutya Koronavírus
A koronavírus általában csak kölyköknél fordul elő. A symptomákat parvo-nak téveszthetik. A Florida Egyetem Állatorvosi Kar szerint a fertőzés kockázata nő, ha a kutyák szorosan együtt élnek. Nagyon fertőző, tüsszentéssel és köhögéssel terjed. A rutin kölyökoltások általában védelmet nyújtanak a koronavírus ellen.
Kutya Bordetella (Kenny Köhögés)
A kenny köhögés gyakran együtt jelentkezik a parvov vírussal vagy a distemperrel, mert nagyon fertőző, és a már betegek nagyon sérelmezhetők. A kenny köhögés általában nem jelent problémát felnőtt kutyáknál otthoni körülmények között. Azonban zsúfolt menhelyekben nehéz kontrollálni.
Macska Fertőző Peritonitis
A macska fertőző peritonitis könnyen terjed, ahol több macska van. Az Auburn Egyetem Állatorvosi Kar megjegyezi, hogy ez a vírus légúti fertőzéseket vagy bélproblémákat okozhat. Bár gyakran halályos, néhány macska túléli gondozással.
Macska Leukémia
A macska leukémia gyakran rákot okoz macskáknál. Még ha elkerülik a daganatokat is, a fertőzött macskák alacsonyabb immunrendszerrel rendelkeznek, így más betegségekhez is hajlamosak. Bár könnyen terjed, van vakcina. A Cornell Egyetem Állatorvosi Kar szerint a más macskákkal élő macskák a leginkább kockázatban vannak, mert a fertőzött macskák a fertőzés terjedésének forrásai a nyál és az orrfolyadékon keresztül.
Ringworm
A ringworm, egy gombás fertőzés, ami bármely állatot érinthet, szőrvesztést és görcsös bört okoz. A területek gyakran viszketnek. A fertőzés könnyen terjed, és gyakran terjed a menhely teljes populációjába. A ringworm terjedhet emberekre is.
Paraziták
A bolyhok és fülpsyllék gyakran gyorsan terjednek a zsúfolt menhelyekben. A bolyhok nem nehéz kezelni. Ha azonban bekerülnek, gyorsan terjednek. A fülpsyllék nehéz megszüntetni, és minden állatot érint, de leginkább a macskákat. A fülpsyllék kezelése időbe telik, mert naponta tisztítani és kezelni kell a fülakat.
Bélparaziták
A csontféreg, görgőféreg és kagylóféreg, gyakori paraziták, a széklet és bolyhok terjesztik. Symptomák: hasmenés, hányás, súlycsökkenés. Görgőféregesek kinyúlhat a hasuk.