A madár és hüllő inkubátorok mindkettő kontrollált feltételeket biztosít a tojásoknak, de alapvetően eltérő biológiai igényeket szolgálnak ki.
Hőmérséklet és páratartalom
A madár inkubátorok jellemzően 36–39 °C (97–103 °F) hőmérsékletet és 40–60% páratartalmat tartanak fenn. A hüllő inkubátorok alacsonyabb hőmérsékleten, kb. 24–32 °C (75–90 °F) működnek, a páratartalom igénye fajfüggően nagyban változik.
Tojás tárolók
A madár inkubátoroknak rögzített alakú, csavart tárolóik vannak a tojások görgetésének megakadályozására. A hüllő inkubátorok rugalmasabb tárolókat használnak a különböző tojás alakok és méretek miatt, gyakran beállítható kompartimentekkel.
Szellőzés és vezérlés
A madár tojásoknak folyamatos friss levegő keringésre van szükség, ezért a madár inkubátorok hangsúlyozzák a szellőzést és a precíz digitális hőmérséklet-vezérlést. A hüllő inkubátoroknak is szellőzés kell, de némely modellek szimulálják az éjszakai hőmérséklet-esést és szélesebb beállítást tesznek lehetővé a faj szerint.
Az inkubátor egyezése a konkrét fajjal elengedhetetlen a sikeres kikeléshez és az egészséges fiókákhoz.