A madarak epifízis mirigye szabályozza több alapvető biológiai funkciót.
Cirkadián ritmus és fotoperiodizmus
A mirigye segít szabályozni a cirkadián ritmusokat és a nappal hosszuságára adott reakciókat. Nappali információt kap a szemek révén, és beállítja a belső óráját, hogy az fiziológiát koordinálja az évszakokkal.
Melatonin termelés
Fő szerepe a melatonin termelése és elszabadítása, ami szabályozza az alvás-ébrenléti ciklusokat, és a sötétségre válaszul szabadul fel.
Évszakos szaporodás
Sok fajban az epifízis mirigye irányítja a szaporodási aktivitást az évszakos fényjelek alapján, befolyásolva a hormonokat, mint a gonadotropin-szabadító hormont.
Vándorlás
A mirigye segíthet a vándorlás környezeti jeleinek feldolgozásában, beleértve a csillagászati navigációt és a mágneses mezőket.
A specifikus funkciók eltérhetnek a fajoktól függően, és a madarak epifízis fiziológiájának kutatása folyamatban van.