A nyugati tavi teknősök számára a legnagyobb veszélyt élőhelyük elpusztítása jelenti. Az emberi populáció növekedésével egyre több területet alakítanak ki otthonok, vállalkozások és mezőgazdaság számára. Ez a fejlődés gyakran elpusztítja vagy lerontja a teknősök élőhelyét, megnehezítve túlélésüket.
Szennyezés
A szennyezés károsíthatja a nyugati tavi teknősöket is. A peszticidek és más vegyszerek szennyezhetik a vízkészleteiket, megbetegíthetik vagy akár meg is ölhetik őket. A szennyezés károsíthatja táplálékforrásaikat is, megnehezítve számukra, hogy elegendő ennivalót találjanak.
Ragadozás
A nyugati tavi teknősöket különféle állatok zsákmányolják, köztük halak, madarak, kígyók és emlősök. Míg a ragadozás az ökoszisztéma természetes része, az élőhelyek elvesztése és más veszélyek miatt a nyugati tavi teknősök sebezhetőbbé váltak a ragadozással szemben.
Klímaváltozás
Az éghajlatváltozás komoly veszélyt jelent a nyugati tavi teknősökre is. Az éghajlat felmelegedésével élőhelyük egyre szárazabbá válik, és egyre kevésbé alkalmas arra, hogy éljenek. Ez megnehezítheti számukra az élelem és menedék megtalálását, valamint növelheti a betegségekre való hajlamukat.
Invazív fajok
Az invazív fajok további veszélyt jelentenek a nyugati tavi teknősökre. Ezek a fajok, amelyek nem őshonosak a teknősök élőhelyén, felülmúlhatják őket a táplálékért és az erőforrásokért, és betegségeket is terjeszthetnek. Egyes invazív fajok, mint például a bikabékák és a vörösfülű csúszómászók, szintén a nyugati tavi teknősök ragadozói.