1. hiányos fosszilis rekordok :A fosszilis nyilvántartás gyakran fragmentált és hiányos, különféle tényezők miatt, például a fosszilis maradványok szűkössége, a tafonikus folyamatok és a különböző organizmusok egyenetlen megőrzése. Ez a hiányosság megnehezítheti a kihalt fajok morfológiájának és anatómiai tulajdonságainak átfogó megértését, amelyek kulcsfontosságúak a pontos osztályozáshoz.
2. :A kövületek elsősorban a kemény szerkezeteket, például a csontokat, a fogakat és a kagylókat őrzik. A lágy szövetek, például az izmok, a szervek és a bőr, ritkán fosszériasak, és jelentős hiányosságokat hagynak a kihalt organizmusok általános megjelenéséről, színezéséről és viselkedéséről. Ez megtámadhatja a meglévő taxonómiai csoportokba való pontos elhelyezését.
3. Taponikus változás :A tafonikus folyamatok, amelyek a halál utáni halál utáni szervezetnél bekövetkező változásokra utalnak, jelentősen megváltoztathatják a maradványok morfológiáját. Az olyan tényezők, mint a megsemmisítés, az időjárás, a szállítás és a temetkezés, torzíthatják, eltörhetik vagy akár megsemmisíthetik a fontos anatómiai jellemzőket, megnehezítve a szervezet azonosítását és osztályozását.
4. Morfológiai konvergencia és rejtélyes fajok :Néhány kihalt organizmus hasonló tulajdonságokat alakíthatott ki más fajokhoz képest, a konvergens evolúció vagy a hasonló ökológiai résekhez való alkalmazkodás miatt. Ez a konvergencia taxonómiai zavarhoz és téves osztályozáshoz vezethet, különösen akkor, ha kizárólag fosszilis bizonyítékokon alapul. A rejtélyes fajok, amelyek megkülönböztetett fajok, de minimális morfológiai különbségeket mutatnak, szintén bonyolíthatják a kihalt szervezetek osztályozását.
5. A genetikai adatok hiánya :A fosszilis bizonyítékok önmagukban nem biztosítják közvetlen hozzáférést a genetikai információkhoz, ami elengedhetetlen a modern taxonómiai módszerekhez, például a DNS -elemzéshez. A genetikai adatok feltárhatják az organizmusok közötti kapcsolatokat, és betekintést nyújthatnak evolúciós történetükbe. Genetikai információk nélkül a kihalt organizmusok besorolása a morfológiai összehasonlításokra korlátozódhat, amelyek nem mindig lehetnek meggyőzőek.
6. :A taxonómiai osztályozásokat folyamatosan felülvizsgálják az új fosszilis felfedezések, a kutatási módszerek fejlődése és az evolúciós kapcsolatok megváltoztatása alapján. A taxonómiának ez a dinamikus jellege azt jelenti, hogy a kizárólag fosszilis bizonyítékokon alapuló osztályozások elavulhatnak vagy felülvizsgáltak, mivel a kihalt szervezetek megértése javul.
E kihívások ellenére a paleontológusok különféle technikákat és megközelítéseket alkalmaznak a kihalt szervezetek osztályozására, ideértve az összehasonlító anatómiát, a funkcionális morfológiát és a filogenetikai elemzést. A fosszilis bizonyítékok más információforrásokkal való kombinálásával, például a szedimentológiával, a paleoecológiával és a biogeográfiával a tudósok arra törekszenek, hogy rekonstruálják a kihalt organizmusok evolúciós történelmét és kapcsolatait, és az élet fája szélesebb kontextusába helyezzék őket.