A felnőtt csokoládé labradorok nem lehetnek természetesen kék szeműek. A csokoládé labradorok standard szemszíne barna.
A kék szem a kutyáknál általában genetikai mutációkhoz vagy orvosi állapotokhoz kapcsolódik, mint a merle gén vagy az albinizmus. Ezek nem jellemzőek a labrador retriverekre, az albinizmus ritka és gyakran más egészségügyi problémákkal jár.
Bár a kék szem bizonyos fajtáknál előfordulhat genetika vagy betegség miatt, a felnőtt csokoládé labradoroknál nem természeti vagy gyakori jellegzetesség.