Az alligatorok a tojásaikat növényi anyag és iszapból készült fészekbe rakják. A tojások általában kb. 5 cm hosszúak és fehéresek. A nőstény őrzi a fészkét, amíg a tojások kikelnek, ami általában kb. 2 hónapig tart. Az alligator tojás átlagos inkubációs ideje kb. 70 nap, bár némelyik 60 napon kikelhet, mások 80 napig is eltarthatnak.