A koi hal színének meghatározása több tényezőtől függ, beleértve a bőrben lévő pigmentek kombinációját, az eloszlását vagy mintázatát, valamint a bőr átlátszóságát vagy nem átlátszóságát.
1. Pigmentáció: A koi halak három fő pigmenttípussal rendelkeznek: melanoforok (fekete/világosbarna), xantoforok (sárga, narancs, vörös), guanoforok (visszaverik a fényt, ezüst/arany/írisz hatást keltve).
2. Mintázat: A pigmentek eloszlása és rendezése határozza meg a koi hal általános mintázatát. Gyakori minták: Kohaku (fehér test vörös foltokkal), Showa (fekete test vörös és fehér foltokkal), Sanke (fekete test vörös és fehér foltokkal, de a fehér terület nagyobb, mint a Showa-nál).
3. Átlátszóság és nem átlátszóság: A koi hal bőr átlátszósága vagy nem átlátszósága befolyásolja, hogyan kölcsönhat a fény a pigmentekkel. Néhány koi áttetsző vagy félig átlátszó bőrrel rendelkezik, mások nem átlátszóval.
4. Genetika: A koi hal genetikai felépítése jelentős szerepet játszik a színében.
5. Környezeti tényezők: Bár a genetika az elsődleges meghatározó, a vízminőség, hőmérséklet és étrend is befolyásolhatja a színek intenzitását és élénkségét.
A koi hal színei egységes árnyalatoktól összetett, élénk mintákig terjedhetnek, több szín kombinálásával.