Három alapvető lépés van a tengervizes szűrőkben és szűrőrendszerekben. Az első a mechanikus szűrés, ami általában szivacs formájában jelenik meg, és a nem oldódott hulladékot választja el az oldódotttól. A második a biológiai szűrés, ami segít lebontani a baktériumokat és ammóniumot nitráttá. A harmadik és utolsó szűrés a kémiai, ami a oldódott hulladékok kezelését segíti.
Szivacs
A szivacs a legjobban ajánlott anyag a tengervizes akvarium szűrőrendszer első lépésében. Az első lépés mechanikus, ahol a nem oldódott hulladékok, mint a felesleges étel vagy a halfekal, elakadnak a szűrőben. A szivacs összegyűjti ezeket, miközben a oldódott hulladékokat tartalmazó víz tovább áramlik a szűrési folyamatban. Mivel a szivacsok megtelik ezekkel a nem oldódott hulladékokkal, legalább havonta egyszer ki kell venni és kitisztítani őket, és legalább évente egyszer vagy kétszer teljesen cserélni, az akvarium méretétől és a halak számától függően.
Bio-médium
A bio-médium vagy biológiai médium egy nitrifikáló baktérium, ami mind a mechanikus szűrőben elakadt nem oldódott hulladékokon, mind az ammóniumot termelő mikroskopikus baktériumokat tartalmazó oldódott hulladékokon működik. Ez a tengervizes szűrőrendszer második, biológiai része. A nitrifikáló baktériumok megevzik a mechanikus szűrésben elakadt nem oldódott hulladékot, és nitrátokat termelnek hulladékként. A nitrátok ezután megölik az ammóniumot termelő baktériumokat, és egyensúlyozzák a pH szinteket az akvariumban. A medence méretétől és/vagy a halak számától függően évente legalább egyszer cserélni kell a bio-médiumot a pH egyensúly fenntartásához.
Szén
A szén a legszélesebben használt és legjobb anyag a tengervizes szűrőrendszer utolsó lépéséhez. Ez a kémiai szűrési folyamat, ahol az oldódott hulladékok, mint a halfecskó és a felesleges ammónium vagy klór "kitisztulnak" a vízből. A szén, ami pózus, átengedi a szennyezett vizet, de kémiailag ragaszkodik a hulladékokhoz. A szént legalább kétheti egyszer ki kell venni és megmosni, és évente legalább kétszer teljesen cserélni, a halak számától és az akvarium méretétől függően.