Kiválasztott anyagok
A tengeri halaknál a fő kiválasztott anyagok: szén-dioxid (CO2) a légzésből; nitrogénes hulladék a fehérjék szénhidráttá alakításából energiáért; és sók a körülvízből. Mindet más módon választják ki, bár néhány szerv képes kezelni több anyagot is.
Vizelet és só
Az élőhelyük miatt a tengeri halak nagy mennyiségű sót vesznek be az ételükkel és a folyamatos sós víz ivásával. Az Illinois Egyetem Állaterőforrás Osztálya szerint, ha a tengeri halak nem választanák ki ezt a sót, az ózmózis révén a bőrön és zsiráfján keresztül sok testvizet veszítenének. A tengeri halak hatékonyan eltávolítják a só ionokat a testükből, részben nagyon koncentrált, kevés vizet tartalmazó vizelet létrehozásával.
Ammónia
Amíg az emlősöknél a nitrogénes hulladék carbamid (vizelet fő összetevője) formájában kerül kiválasztásra, a tengeri halaknál a nitrogénes hulladék nagy része ammónia formáját ölti. Az ammónia sokkal merevebb, mint a carbamid. Azonban a halak által kiválasztott ammónia gyorsan sejteti a körülvíz tengervíze. Ezért a medencékben tartott halak elszédülés kockázatával vannak szemben, hacsak a vizet nem cserélik vagy frissítik.
Zsiráfjak
A tengeri halak nitrogénes hulladékának többsége a zsiráfakon keresztül kerül kiválasztásra – elsősorban ammónia formájában. A zsiráfak tartalmazzák azokat a sejteket is, amelyek lehetővé teszik a natrium és klorid – vagyis a só – felszabadulását. Ugyanakkor, miközben a zsiráfak kiválasztják az ammóniát, CO2-t és a sót, nagy mennyiségű vizet is elveszítenek. Ezért a halnak folyamatosan sós vizet kell ivania. A halaknak az ivás és a "légzés" gyakorlatilag ugyanaz, hiszen az oxigént a víz ivásával a zsiráfakon keresztül szerezik be.
A vese
Mint minden gerincest, a halaknak is van két vese. A vese egyik fő funkciója az kiválasztás és a test vizszintjének szabályozása. Egy egyensúlyi eszközként működik, biztosítva, hogy a testnek a megfelelő víz-só és más kémia aránya legyen. A vesek termelik a nitrogénes hulladékot is, ami utána carbamiddal a hal vizeletében kerül kiválasztásra.