A tókat mélység és fény szerint zónákra osztják.
Fő zónák
- Littoral (parti): mélyen, gazdag növényzettel.
- Limnetic (nyíltvíz): nyílt, napfényben fürkészó felszíni víz.
- Profundal (mélyvíz): mély, sötét, alacsony oxigén tartalmú zóna.
- Benthic (tengeralatti): az aljzati réteg.
További különbségek: aerób és anaerób rétegek az oxigénszint alapján.