Aktivált szén használható szűrőanyagként egy hal tó szűrőrendszerben. Rendkívül adsorbeáló, és eltávolíthatja a tisztaságtalanokat, szerves anyagokat, szennyezőket és rossz szagokat a vízből. Nagy felülete és pórus szerkezete lehetővé teszi a kontaminánszűrést, miközben a víz áthalad rajta.
Aktivált szén azonban nem biztosít jelentősebb biológiai szűrést, és nem tudja eltávolítani az ammóniát vagy a nitriteket. Más szűrőanyagokkal, például biológiai médiával kell kombinálni egy kiegyensúlyozott tó ökoszisztéma fenntartása érdekében.