A fajok veszélyeztetettsége leggyakoribb oka az élőhely-elvesztés. Ez akkor következik be, ha egy faj természeti környezete elpusztul vagy jelentősen megváltozik, megnehezítve vagy lehetetlenné téve a túlélést. Okok: urbanizáció, erdőirtás, bányászat, szennyezés, klímaváltozás. Az élőhely-elvesztés a biodiverzitás egyik legnagyobb fenyegetése, és számított kipusztulásokhoz vezetett világszerte.