Az Everglades fajai több komoly fenyegetés miatt szorulnak védelmet:
- Élőhelyrombolás: az urbanizáció, a mezőgazdaság és a vízkielterelés szétdarabolta a mocsarára jellemző élőhelyeket.
- Vízminőség romlása: a mezőgazdasági lefolyás és a szennyezés algavírágzást és oxigénhiányt okoz.
- Éghajlatváltozás: a tengerszint emelkedése, a magasabb hőmérséklet és a csapadékváltozás terheli az ökoszisztémát.
- Bevándorló fajok: az idegen növények és állatok kiszorítják a őshonos fajokat és megzavarják az étrendláncokat.
- Túlzott kihasználás: a vadászat, a halászat és a háziasított állatok kereskedelme csökkentette néhány populációt.
Az őrzés, az élőhely-visszaállítás, a vízminőség-javítás és a bevándorló fajok kontrollja elengedhetetlen az Everglades biodiverzitás megőrzéséhez.