1. Esőerdő
A Fülöp-szigetekben 11 millió hektárnál több esőerdő van, így az egyik legsokasabb fajok otthona a világon. Ez az erdők otthont adnak majmoknak, madaraknak, hüllőknek és hercínőknek. Ikonikus esőerdő állatok: a tarsziér, a fülöp-szigeti sas és a palawani pávafajd.
2. Szikes
A Fülöp-szigetek szikeskei a központi és északi részekben találhatók. Ezek a területek magas fűvekből és kevés fából állnak. Szikes állatok: a fülöp-szigeti szarvas, a viszai borz és a fülöp-szigeti sas.
3. Korallzátonyok
A Fülöp-szigetek otthont adnak a világ legszebb korallzátonyainak. Ezek a zátonyok halakat, korallokat, molluszkokat és rakoformákat támasztanak. Ikonikus tengeri állatok: a clownhal, a papagájhal és a tengeri teknős.
4. Mangróvek
A Fülöp-szigetek mangróvai a partok mentén találhatók. Ezek a területeken olyan fák nőnek, amelyek sótartalmú vízben élnek. Mangróvi állatok: a mangróvi gólya, a varánusz és a sárúszó.