1. emésztési szimbiózis: Bizonyos flagellátok az állatok emésztőrendszereiben, például a termeszek és a fafajtás csótányok, a cellulóz lebontásában és felhasználásában, egy komplex cukorral, amelyet sok állat önmagában nem képes megemészteni. Ezek a flagellátok elősegítik a gazdaszervezeteket a tápanyagok növényi anyagból történő kinyerésében, lehetővé téve számukra, hogy az étrendben virágzhassanak, amely elsősorban fából vagy más cellulózban gazdag anyagokból áll.
2. Tápanyag -csere: Néhány flagellát, mint például egyes tengeri gerinctelenek bélében, a tápanyag -csere szimbiózisban vesz részt. Alapvető tápanyagokat, például vitaminokat és aminosavakat biztosítanak a gazdaszervezetek számára, amelyeket az állatoknak nehezen tudnának megszerezni a környezetükből. Cserébe a flagellátok védelmet és hozzáférést kapnak a gazdagép emésztőrendszerében lévő tápanyagokhoz.
3. Bio-lumineszcens szimbiózis: Néhány tengeri állat, például bizonyos medúza és mélytengeri halak, bio-lumineszcens flagellátokkal élnek a szövetekben. Ezek a flagellátok biokémiai reakciók révén fényt termelnek, és az állatok különféle célokra használják ezt a fényt, ideértve a zsákmány vonzását, a ragadozók visszatartását vagy a fajok többi tagjával való kommunikációt.
4. reprodukciós segítség: Bizonyos flagellátok segítik a gazdaszervezeteket a reprodukcióban. Például bizonyos hangyák és termeszek fajok szimbiotikus flagellátokkal rendelkeznek, amelyek segítenek nekik több szaporodást (Queens és Kings) előállítani. Ezek a flagellátok manipulálják a házigazda fejlődési útvonalait, biztosítva a gazdaszervezet kolónia túlélését és elterjedését.
Érdemes megjegyezni, hogy nem minden olyan interakció, amelyben a flagellátokkal és az állatokkal járó interakció nem előnyös. Egyes flagellátok valóban árthatnak, mint paraziták, ami betegségekhez és káros hatásokhoz vezet a gazdaszervezetekre. Számos flagellát azonban olyan létfontosságú kölcsönös kapcsolatokban is részt vesz, amelyek hozzájárulnak mind a flagellate, mind az állatok általános egészségéhez, túléléséhez és ökológiai sikeréhez.