Élőhelyelvesztés
Erdőirtás fászállításra, mezőgazdaságra, bányászatra, valamint útepítés szigeteli és pusztítja el a jaguár élőhelyét.
Emberi konfliktus
A tenyésztés károsodása bosszúvadászatot eredményez, az illegális vadászat bőrért és testrészekért folytatódik.
Egyéb fenyegetések
Klíma változás, betegségek, szennyezés tovább rontja a helyzetet. Kulcsfajként az elvesztésük megzavarná a dzsungel ökoszisztémáját. Védelem: védett területek, közösségi bevonás, vadászat-ellen.