A fajképződés, azaz az új fajok kialakulásának folyamata, akkor következhet be, ha populációk földrajzilag elszigetelődnek. Ez többféle módon is történhet:
- Kontinens-drift: Ahogy a kontinensek elszakadnak egymástól, egykor összekötött populációk elkülönülhetnek. Ezt feltételezik, hogy magyarázza a bejáratnősök elterjedését Ausztráliában és Dél-Amerikában.
- Vicariancia: Egy fizikai akadály, mint egy hegység vagy folyó, szétválaszt egy populációt, allopatrikus fajképződéshez vezetve. Ez magyarázhatja az észak- és dél-amerikai szarvasfajok elkülönülését a panamai szárazföldön keresztül.
- Diszperzió: Egyedek új területre költöznek és új populációt alapítnak, néha szél, víz vagy szárazföldi hídok segítségével. Ezt hívják, hogy magyarázza a hawaii mézicsók őseinek elterjedését.
- Klímaváltozás: Az változó éghajlatok szétdarabolhatják az élőhelyeket, megnehezítve a kereszteződést, és potenciálisan fajképződéshez vezetve. Ez hozzájárulhatott az afrikai elefántok savannai és erdőalfajaira való osztásához.